台積電董事長張忠謀表態支持營利事業所得稅與綜合所得稅兩稅分開，
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，他指出，
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，成長的企業應繼續不斷投資，
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，但兩稅合一及未分配盈餘課稅，
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，會鼓勵企業將盈餘分配股東，
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，是不好的政策。
財政部長張盛和表示，
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，非常感謝張忠謀對稅制的建議，
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，中研院也提出相同的建議，認為兩稅應全部分開。
張盛和說，立法院才剛剛通過立法，將兩稅合一制度從全部合一改為部分合一，且正式實施日期是明年度，還沒正式上路實施，基於維持稅制的安定性，實施一段時間後再檢討比較適宜。
張盛和說，此次稅改沒有採行兩稅完全分開、兩稅無法扣抵的激烈變革，是希望循序漸進，對業界的衝擊不要太大。
賦稅署高層解釋，當年實施兩稅合一制度，是為消除營利所得的重複課稅，以提高投資意願，但因為營所稅稅率為百分之十七，綜所稅最高稅率為百分之四十五，兩者稅率差距太大，為避免公司保留盈餘避稅，才配套訂定未分配盈餘加課百分之十的制度。
中研院研究指出，近年來學理及實證上已推翻兩稅分開是重複課稅的說法，且台灣實施兩稅合一制度後，不但沒帶來投資意願提高的好處，反而帶來所得分配惡化的惡果，建議廢除兩稅合一制度。多數OECD 及歐盟國家，都已廢除兩稅合一制度，廢除兩稅合一制符合世界潮流。，